本站设有一个岛式站台。

2018年8月16日，广州捷运21号线确定的21个站名（从西往东）包括：员村站、天河公园站、棠东站、黄村站、大观南路站、天河智慧城站、神舟路站、科学城站、苏元站、水西站、长平站、金坑站、镇龙西站、镇龙站、中新站、坑贝站、凤岗站、朱村站、山田站、钟岗站、增城广场站。

2019年7月，广州捷运21号线后通段的3个站点（大观南路站、天河智慧城站与神舟路站）被广视新闻所报导，随后在部分站点试点的广州捷运现网图（包含广州捷运8号线北延段与广州捷运21号线后通段）全部被召回。

截至2019年8月，广州捷运21号线后通段与该站暂未开通。

乘客在智慧车站可以体验到：智慧型语音购票；智慧型客服，客服机器人“悠悠”；智慧型票亭，刷脸、刷指静脉过闸……在安检方面，设定智慧型安检闸机，可以实现票务、安检一体通过，做到智慧型人包对应；站内迷失方向或要找洗手间等，用手机扫描车站二维码，电子地图可以站内导航；走到站台门前等车的时候，站台门智慧型信息屏还会显示等车时间、车厢客流密度，乘客能选择合适的车厢去等待。