深惠城际西线(经镇隆)
线路由莞惠城际轨道陈江站引出，向南经陈江汽车站，沿国道G 205、镇隆、新圩、惠盐高速公路进入深圳龙岗，与深圳前海线衔接，线路全长约23千米。远期该线路由陈江站向东北方向延伸至江北，服务仲恺沿线片区，线路全长约19.4千米。近远期线路总长约42.4千米。
深惠城际东线(经惠阳)
线路由莞惠城际轨道客运北站北端引出，沿北环大道向东穿金龙大道、惠民大道、东江后经水口、龙湖、体育中心、永湖、淡水，终点至惠州南站与厦深铁路换乘，向西进入深圳东站。线路全长约54千米。

据悉，深惠城际轨道线路已经进入前期线路论证阶段。按照初期规划，前期构想或经龙岗、坪山、惠阳等地。线路建成后将成为我市与深圳之间的一条快捷通道。