医院创建于1997年1月，由原中国中医研究院骨伤科研究所、北京针灸骨伤学院附属医院和骨伤系合併组建。

2007年，根据中国中医科学院科技体制改革方案，中国中医研究院骨伤科医院整体纳入望京医院，“中国中医研究院骨伤科医院”更名为“中国中医科学院望京医院骨伤医疗中心”。

医院设有急诊科、重症监护病房（ICU）、心血管内科（内设CCU）、肾病内分泌科、脾胃病科、呼吸科、风湿病科、肿瘤科、脊柱科、创伤科、骨伤综合科、骨关节科、外科、妇科、儿科、针灸科、血液净化中心、治未病科、康复科等34个临床科室和9个医技科室。

骨伤科是国家临床重点专科，国家中医药管理局重点学科、重点专科，国家中医药管理局筋伤治疗手法重点研究室；肾病科是国家临床重点专科、国家中医重点专科；脾胃病科是国家临床重点专科、国家中医重点专科建设单位；康复科是国家临床重点专科、国家中医重点专科；眼科是国家中医重点专科协作组成员单位；急诊科是国家中医重点专科、全国中医急诊临床基地建设单位；重症医学科是国家中医重点专科培育项目单位；风湿病科是国家中医重点专科；肿瘤科是国家中医重点专科建设单位；呼吸科是国家中医重点专科建设单位；针灸科是全国针灸医疗中心北京分中心，北京市中医管理局重点专科；妇科是北京市中医管理局重点专科；心血管科是国家中医重点专科协作组成员单位；儿科是北京市中医儿科诊疗中心建设单位。

医院编制床位1100张，开放床位701张，配有全自动生化分析仪、全自动免疫发光分析仪、全自动血细胞分析仪、全自动血凝仪、全自动电泳仪、血气分析仪、基因扩增仪、血流变分析仪、酶免分析仪、尿沉渣分析仪、乾化学分析仪、尿十项分析仪、配血仪、核磁共振仪、高频X线乳腺机、牙科全景机、岛津7800螺旋CT等医疗设备。

北京市朝阳区望京中环南路6号。