《中国微生态学杂誌》创刊于1988年，是由中华人民共和国国家卫生和计画生育委员会主管，中华预防医学会、大连医科大学主办的中华预防医学会系列刊物。

据2018年9月《中国微生态学杂誌》编辑部官网显示，《中国微生态学杂誌》编辑委员会编委有63人，顾问22人，特邀编委84人。

据2018年9月16日中国知网显示，《中国微生态学杂誌》共出版文献7481篇、总被下载1010054次、总被引44755次、（2017版）複合影响因子为0.854、（2017版）综合影响因子为0.710。据2018年9月16日万方数据知识服务平台显示，《中国微生态学杂誌》载文量为5948篇，被引量为28499次，下载量为71751次；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《中国微生态学杂誌》影响因子为1.12。