海运学院为浙江交通职业技术学院二级学院，于2004年4月由原航海技术系和轮机工程系合併成立。现开办五个专业：海洋船舶驾驶、轮机技术与管理、国际航运业务管理、货柜运输管理与外轮理货、船舶机械製造与维修，其中海洋船舶驾驶和轮机技术与管理专业为学院骨干专业，46年来已为海运企事业单位培养了 4000余名专业人才，浙江省大中型海运企业中绝大多数船长、轮机长源出于此。近几年水上专业毕业生的就业率均为100%。目前，海洋船舶驾驶专业为教育部教学改革试点专业，轮机技术与管理专业为浙江省高职重点建设专业，轮机实训中心为浙江省高职示範性实践教学基地。2004年全日制学生规模为1000人。