人群中林二二自认死者亲属，挺身而出鸣冤，不满的人群愈聚愈众，人声鼎沸，围署不散。督办船政黎兆棠惊恐万状，于七月二十五日早上，驰谕闽县候补知县缪嘉行迅速派人前来。缪嘉行提审死者母亲林卢氏及疑兇朱得桂，朱供认不讳。死者亲属背黄状哀求工人相助，工人愤而拆毁船政衙门头门，推倒东西辕门，将鸣冤鼓丢弃于官厅池中。闽浙总督何□闻讯，饬派水师营员弁前往镇压，黎兆棠派福靖后营练勇包围工人和农民，逮捕一批无辜民众。七月二十八日，船政总监工许某又开列惩罚工人名单，引起工人更大愤怒，工人坚持罢工数日，黎兆棠眼见将影响兵船下水期限，被迫下令处斩朱得桂，“正军法以儆将来”。同时，将缪嘉行、张道亨等人撤任撤差。工人斗争取得胜利。上海《申报》为此专门发表《论船局命案》社论，忧心忡忡地写道：“窃恐局中营勇工匠，从此蔑视各员并可挟制钦差”。这场斗争，是中国产业工人最早的罢工运动。