审计司是宋代以“审计”命名的审计机构在我国历史上是第一次，是由诸军诸司专勾司更名而来。

南宋建炎元年(公元1127年)，康王赵构承宋统，《宋吏·高宗纪》载，“五月庚寅朔帝登坛受命”继皇帝位。阴曆五月庚寅日，是十二日，此前一天，即五月十一日，高宗下诏将诸军诸司专勾司改为审计司。《宋会要》职官二十七之六十一记载，“高宗建炎元年五月十一日诏：诸司专司、诸军专司，专字下犯御名同音者，改作诸军诸司审计司”(“构”、“勾”同音)。

皇帝诏令将专勾司从事的以审查账薄为基本特徵的行为，概括为“审计”，用以替代“专勾”一词，更名诸军诸司专勾司为诸军诸司审计司。