1996年柯南TV播放伊始就担任柯南动画製作人，直至2011年的TV 626，长达16年之久；同时吉冈先生也是柯南剧场版M 1~15的製作人。

2012年，有中国冬粉在推特上询问其中国是否会引进柯南第十六部剧场版《第十一名前锋》，得到了他的回应“正在与中方交涉中，要春天之后才能决定下来。”该片最终因日本政府执意宣布“钓鱼岛国有化”而未能顺利公映。

2015年的《电波教师》是吉冈昌仁最后一部担纲製作人的作品。

2016年1月14日，因病离世，享年56岁。根据其家人要求，葬礼仅亲属参加。

《名侦探柯南》1996年柯南TV版至2011年的TV版的第626集；《魔法骑士》、《史上最强弟子兼一》、《魔术快斗》(TMS版)、《恶作剧之吻Kiss》、《电波教师》、《世界末的魔术师》、《贝克街的亡灵》、《人鱼之森》、《格斗美神 武龙》等。

吉冈昌仁也製作过《人鱼之森》、《格斗美神 武龙》、《魔法骑士》、《史上最强弟子兼一》、《魔术快斗》（TMS版）、《恶作剧之吻Kiss》、《电波教师》等众多动画作品。

吉冈昌仁的去世，不仅相关人员感到不捨，许多柯南冬粉也在网上追思这位幕后功臣，有网友感性说“希望在另个世界也能继续记着柯南”。