2018年7月5日起，第7号颱风派比安带来的暖湿气流使原本停留在日本九州至中部地区的“梅雨前线”活跃。与此伴随的太平洋高压衰退，在日本西部各地形成了活跃云层，是本次灾害发生的成因。

2018年7月6日，日本西部地区多地24小时降雨量突破300mm；日本气象厅于17时10分在长崎县、福冈县与佐贺县、19点40分在广岛县、冈山县与鸟取县、22点50分在京都府与兵库县合计7县1府发表了日本气象厅制定的最高级别大雨特别警报，这是日本气象厅自警报制度设立以来发布的最大规模警报。并同时在日本西部地区多地发表了大雨警报及注意报、洪水警报及注意报。7月7日12点50分，日本气象厅对岐阜县发表大雨特别警报。7月8日6点50分，日本气象厅对高知县、爱媛县发表大雨特别警报；至此，本次灾害特别警报覆盖日本10县1府。

2018年6月28日至7月8日，日本四国地区累计平均降雨量达1800毫米、东海地区1200毫米、九州北部地区900毫米、近畿地区600毫米，月平均降雨量约是往年同期的2至4倍。此外，九州北部地区、四国地区、中国地区、近畿地区、东海地区多地24、48、72小时累计降雨量刷新观测史记录；日本全境123个观测点48小时降雨量历史观测记录、119个观测点72小时降雨量历史观测记录被刷新。截至7月9日0时（日本标準时间，简称“JST”，下同），本次暴雨灾害最大降雨量出现在高知县安芸郡马路村，达到1852.5mm，突破该地观测史极值。

截至2018年7月12日20时（JST），本次灾害已累计造成201人死亡、139人受伤，另有30人下落不明。灾害发生后，日本15个府县政府部门累计对120.4万户家庭共262.6万人次发布了紧急避难指示和避难劝告。截至2018年7月8日15时（JST），日本西部地区仍有3238个避难所收容受灾民众约3万人次。

截至2018年7月15日，本次灾害因洪水、土石流、山体滑坡等次生灾害，已致209人遇难，仍有20人失蹤。冈山县仓敷市真备町是本次灾害中受灾较严重的地区，真备町因堤坝决裂致半数以上区域被洪水淹没，仅该地区遇难者人数就达42人。而在冈山县的56名遇难者当中，有53人死因是溺水。此外，土石流、山体滑坡也是导致本次灾害遇难人数上涨的主要原因。据日本国土交通省2018年7月12日统计，日本全国31个道府县共出现519处沙土滑脱引发的次生灾害，其中382处为山体垮塌，119处为土石流，18处为滑坡，而因沙土灾害遇难的遇难人数达57人。

截至2018年15日下午7时，在西日本暴雨灾害中，日本14个府县已经有212人确认死亡。其中，仅广岛县死亡人数就达到100人，在重灾区的4个县有21人失蹤。

截至2018年7月17日，西日本暴雨灾区死亡人数在14个府县达到222人。日本总务省消防厅称，截至16日晚上8点，16个府县约有4700人仍过着疏散生活。

据日本消防厅统计，截至2018年7月11日13时（JST），本次暴雨灾害共造成日本全国87栋住宅完全损坏、472栋住宅部分损坏。另有5栋公共建筑物受损。

灾害发生后，北九州高速道路全线、西日本高速道路、中日本高速道路、东日本高速道路运营的部分高速公路及日本国道部分线路因雨量过大或道路受损禁止通行。高速公路通行状况与具体受损情况见下表（截至2018年7月10日13时(JST)）：

受本次灾害影响，日本西部地区多个铁路站台及28家铁路公司线路沿线出现不同程度受损，铁路运输系统随之出现大规模瘫痪。自2018年7月3日起，西日本旅客铁道（JR西日本）营运的山阳新干线新大阪至小仓站区间线路全线停运；越美北线、小浜线、 奈良线、舞鹤线、和歌山线、阪和线、樱井线、环状线全线停运；高山线、城端线、北陆线、大糸线、福知山线、加古川线、姫新线、东海道线、山阳线、山阴线、赤穗线、草津线、关西线、播但线、片町线、纪势线、芸备线、因美线、木次线、福盐线、伯备线、吴线、宇野线、本四备讃线、津山线、吉备线、山口线、宇部线、小野田线、美禰线部分区间停运；东海旅客铁道（JR东海）营运的高山线、饭田线、东海道线、中央线、御殿场线部分区间停运；北海道旅客铁道（JR北海道）营运的函馆线、宗谷线、石北线、留萌线、富良野线、根室线、札沼线、石胜线、室兰线部分区间停运；四国旅客铁道（JR四国）营运的土讃线、予土线、本四备讃线、牟岐线、予讃线、高徳线鸣门线、牟岐线、徳岛线、予土线部分区间停运；九州旅客铁道（JR九州）营运的肥萨线、吉都线、日南线全线停运；日丰线、指宿枕崎线、日南线、唐津线、山阳线、鹿児岛线、筑丰线 、日田彦山线、后藤寺线区间停运。此外，其他各大铁路公司及私铁线路的营运均受到不同程度影响，嵯峨野观光铁道、阪急电铁、南海电气铁道、南海电铁、WILLER TRAINS、近畿日本铁道、京阪电气铁道、土佐黑潮铁道、箱根登山铁道 、樽见铁道、长良川铁道、黑部峡谷铁道、信浓铁道、能势电铁、和歌山电铁、若樱铁道、锦川铁道、神户电铁、叡山电铁、筑丰电气铁道、平成筑丰铁道、南阿苏铁道、松浦铁道所运营的部分线路停运。本次停运规模涉及26家铁路公司的97条线路，物流铁路运输方面也受到较大规模影响（详见“物流”目录）。7月7日起，各铁路线路陆续恢复正常营运。

被洪水吞噬的JR西日本芸备线铁路架桥（摄于2018年7月7日）

受本次灾害影响，2018年7月7日开始广岛机场和鹿儿岛机场出现不同程度航班延误，总计70架次航班滞留机场。7月9日起，各航空公司航班陆续恢复正常营运。

本次灾害导致鸟取县、岛根县、冈山县、广岛县、山口县、爱媛县内累计188000户数用户停电。截至2018年7月9日6时（JST），仍有5100户未能恢复电力供应。此外，受灾地区淡水供应受到较大影响，广岛县等12县共有24万4000户数用户自来水管道停止供水，日本防卫省自卫队使用净水车为断水地区灾民提供生活用水保障。

据日本农林产业省统计，持续的暴雨天气伴随的土石流、洪水等次生灾害，使森林、林道、农田、农场、堤坝等农业基础设施受损严重，预计此次灾害对农业、林业、水产养殖业累计造成的直接经济损失将超过25.8亿日元。

灾害发生后，广岛县、冈山县等地多处河流决堤，国土交通省使用56辆水泵车在堤坝受损地区展开排水作业。截至2018年7月10日5时（JST），日本全国共有28条河流的46处堤坝出现不同程度受损。

灾害发生后，日本全国81个邮政局停止接受邮件和储蓄等视窗服务业务。受高速公路限行、铁路停运等因素叠加影响，日本境内部分邮件将大幅延迟配送。铁路方面，日本货物铁道（JR货物）所营运的434条货物列车停运，预计将有数十万吨货物滞仓。

日本西部地区约有1万9500条网路线路受到此次灾害影响，通信受到阻碍。

棒球方面，原定于2018年7月5日举行的日本职业棒球联赛中央联盟和太平洋联盟中日龙队对阵阪神虎等3场比赛、7月6日举行的东京养乐多燕子对阵中日龙队等3场比赛、7月7日举行的横滨DeNA海湾之星对阵阪神虎等2场比赛共8场比赛受暴雨影响延期举行。7月8日，日本职业棒球联赛宣布出于安全考虑，原定于9日、10日、11日在广岛县马自达球场内举行广岛东洋鲤鱼对阵阪神虎3连战延期开赛。

足球方面，原定于2018年7月7日举行的日本职业足球乙级联赛（J2联赛）第22轮京都不死鸟对阵福冈黄蜂的比赛、日本职业足球丙级联赛（J3联赛）第17轮鸟取飞翔对阵群马草津温泉的比赛、北九州向日葵对阵鹿儿岛联的比赛由于暴雨影响延期举行。此外，原定于7月11日举行的第98届天皇杯全日本足球锦标赛第3轮广岛三箭对阵名古屋鲸鱼的比赛也受灾害影响延期开赛。

2018年7月6日23时30分左右，位于冈山县总社市下原的“朝日铝製品”工厂溶解炉发生爆炸事故，包括工厂及周边的住宅在内的3栋建筑物全部烧毁。据报导，本次爆炸起因可能是连日暴雨导致的电路漏电短路。

日本首相官邸于2018年7月6日13时58分设定“首相官邸联络室”，同时内阁官房长官指示各省厅扩大合作与情报收集範围以应对可能发生的灾害情况。7月7日10时，首相官邸召开关係内阁集体会议，日本首相安倍晋三要求救援部队要在受害者“生命第一”的方针下全力展开救援，并指示各部门加强联络机制以协助居民开展避难活动和灾后重建工作。7月7日10时20分，“首相官邸联络室”改组为“首相官邸对策室”。7月9日，日本首相安倍晋三为应对本次暴雨灾情，取消了原定于11日启程的欧洲、中东4国访问，安倍晋三原计画在访问期间出席日欧经济合作协定签字仪式及与法国总统马克龙的日法首脑会谈。7月11日，日本首相安倍晋三前往位于浸水重灾区冈山县仓敷市的仓敷市立第二福田国小避难所及高梁市山体滑坡现场视察灾情。

2018年7月11日，日本首相安倍晋三视察仓敷市第二福田国小避难所

日本内閤府于2018年7月2日13时30分设定“情报联络室”、7月6日13时58分设定“情报对策室”、7月7日10时20分设定“灾害对策室”以应对可能发生的灾害情况。7月6日12时，内閤府首批情报先遣部队出发前往广岛县县厅。7月8日8时整，由防灾大臣指挥的“紧急灾害对策本部”设立；这是内閤府自2016年4·14熊本地震后时隔2年再度启用“紧急灾害对策本部”制度。9时整，“紧急灾害对策本部”举行第一次本部会议确立了针对本次暴雨灾害的防灾与救援方针。7月9日，“紧急灾害对策本部”召开第二次会议。7月10日，“紧急灾害对策本部”召开第三次会议，会议确立了有关灾区物资运输的行动方针。日本首相安倍晋三在会议中提出了由国家财政预算拨款约20亿日元支援灾区的方案。7月11日，日本内阁官房长官菅义伟在例行记者会上表示，本次灾害中警察、消防、自卫队、海上保全厅等部门共调遣83架直升机参与灾区搜救活动，救灾规模部队达到7万5千人。

2018年7月14日，日本政府也通过了把西日本暴雨指定为“特定紧急灾害”的内阁会议决定。

2018年7月10日，日本国会众议院举行第196次全体会议常会，会议全体表决通过了《关于平成三十年七月暴雨灾害对策决议案》，决议要求政府在此次灾害中尽全力救助人命、支援灾区，并向灾区民众提供安心、安全的避难所支援；对有关受灾自治体提供必要的财政支持，查明灾情并做好医疗保障、灾民安置等善后处置工作；此外，决议还对针对协助受灾民众心理健康与生活状态恢复、灾区灾后重建复兴等内容进行详细商讨。

2018年7月10日，日本众议院全票通过《暴雨灾害对策决议案》

日本警察厅于2018年6月29日设定以灾害对策室长为首的“灾害情报联络室”，联络室通过各管区警察局收集灾害情报；7月7日，“灾害情报联络室”改组为以警备局长为首的“灾害警备本部”。截至7月8日17时（JST），警察厅下属14个道府县厅警察本部共组建557人的灾害派遣队前往灾区展开救援活动。

日本总务省消防厅于2018年7月3日11时30分设定以应急对策室长为首的“消防厅灾害对策室”收集灾害情报、7月6日9时改组为以国民保护·防灾部长为首的“消防厅灾害对策本部”，同日20时30分再次改组为以消防厅长官为首的“消防厅灾害对策本部”。7月6日22时15分，首批消防指挥支援队由大阪市消防局和堺市消防局前往广岛县，各县消防厅相继组建紧急消防救援队赶赴灾区。次日，福冈县、广岛县、奈良县、山口县、冈山县、德岛县、熊本县、大分县等县出动消防防灾直升机参与救援；此外，东京都、神奈川县、埼玉县等关东地区消防本部也出动救援部队及直升机进行增援。7日晚间，爱知县冈崎市消防本部部署消防特种车辆“红色沙罗曼蛇”协助灾区救援物资运输和灾民救助工作。

2018年7月7日，一架消防救援直升机盘旋在灾区上空等待救援

日本气象厅于2018年7月5日14时召开临时新闻发布会，预期在8日左右西日本和东日本地区将出现破记录性的特大暴雨，呼吁社会各界做好预防準备并全力应对可能发生的灾情。7月6日17时10分，气象厅在福冈县等县发出首个大雨特别警报，同时气象厅”灾害对策本部”成立。7月7日起，日本气象厅对22个道府县地方公共団体派遣气象厅防灾对应志愿队（JETT）以提供气象情报技术支持。

日本防卫省于2018年7月6日13时58分设定“灾害对策联络室”、7月7日10时20分设定“灾害对策室”、7月8日8时设定“灾害对策本部”以应对可能发生的灾害情况。7月6日凌晨起，防卫省在京都府、高知县、福冈县、广岛县、冈山县、爱媛县、山口县、兵库县合计7县1府调遣陆上自卫队部队参与灾区救援工作。截至7月8日23时（JST），陆海空各自卫队部队累计派遣救援人员约27300人。

日本三大通信企业KDDI、Softbank、NTT DOCOMO于2018年7月7日起面向冈山县、广岛县、爱媛县全境开放免费公共Wi-Fi连线服务，以保证灾区民众维持正常通讯；同时，在6·18大阪地震时开设的“灾害留言板”也在此次灾害中继续投入使用，灾区民众可统一在此留言板发布求助信息。此外，雅虎日本与丰田汽车公司共同发布了针对受灾地区的“灾区通行地图”服务，并在相关网页实时更新灾区道路通行状况。