2013年9月13日13时35分，上海中心气象台拉响雷电和大风黄色预警。16时18分，又拉响暴雨橙色预警，16时44分紧急升级为暴雨红色预警。这也是上海市自2009年来首次拉响暴雨红色预警。市防汛指挥部也于16时28分发布防汛防台橙色预警信号，启动二级应急回响。

2013年9月13日7时，全市测得雨量数据的461个测站中有21个测站达到大暴雨标準，有74个测站达到暴雨标準，有46个测站达到大雨标準。降雨主要集中在下午4时至傍晚5时，最大小时雨量超过100毫米的有10个，其中小时雨量最大为浦东新区南干线124毫米，浦东、黄浦、杨浦、长宁等区过程雨量较大、降雨比较集中。由于短时雨量集中，加之进水口被大风颳落的树叶堵塞，造成浦东、黄浦、杨浦、长宁等区80多条（段）道路短时积水20-50厘米，部分老小区内道路积水10-30厘米。

市委书记韩正，市委副书记、市长杨雄对雨情十分关注，要求城市运行各部门全力以赴、相互配合，尽全力保障城市运行安全。

雨情发生后，各排水泵站当即转入暴雨模式运行；各水闸加强运行调度，努力降低河道水位；全市1000多名量放水职工迅速赶赴积水路段清除进水口垃圾；全市近百辆消防车和移动排水泵车赶赴积水严重地区抢排积水。截至当晚10时许，各积水路段积水基本排除。

2013年9月13日，受雷暴云团影响，瞬间暴雨侵城。在狂风暴雨的兇猛袭击之下，上海部分地区降水量超过100毫米，气象台在16时44分升级预警级别，发出了罕见的暴雨“红牌”警告。

9·13上海特大暴雨

正逢交通尖峰时段的这场暴雨，给地面交通带来严重影响，几乎已经瘫痪。浦东主干道世纪大道路段积水没过了车轮，不时有小车抛锚。市区各个高架道路上车流缓慢，出现拥堵。

与此同时，上海捷运多条线路也因暴雨影响正常运营。正值下班晚高峰时候，造成车站内乘客大量积压。

下午4时许，6号线因供电设备故障，云山路往五洲大道方向列车限速运行，发车班次间隔延长。随后港城路至五洲大道、云山路至东方体育中心小交路运行，五洲大道至云山路方向单线双向运行。

后因外部雨水倒灌，引发2号线信号设备故障，人民广场往广兰路方向列车限速运行，世纪大道站因大客流已採取进一步限流措施，4、6号线採取一列隔一列跳站运行模式。随着积水情况加剧，人民广场至上海科技馆站列车只能暂停运行，2号线交路调整为徐泾东至人民广场、广兰路至上海科技馆小交路运行。同时，2号线中山公园、江苏路、静安寺、人民广场、南京东路、世纪大道等所有换乘车站的换入均採取限流措施。陆家嘴、东昌路站採取只出不进的限流措施。

暴雨影响