孔教授在工程科学技术方面的主要成就在于他对光合作用固碳过程中主要碳酶RuBisCo的特殊贡献,RuBisCo的功能左右植物的产量,所以为研究农业增产者所必须了解的步骤,孔教授对研究RuBisCo有杰出的成就,他不但首先由分子学的技术正确的找出RuBisCo大小亚基的遗传位置,并用育种的方法,创出不同大小亚基的组合,以便研究其不同组合对生产的影响,由此而激起世界学者的重视,掀起研究RuBisCo的热潮,导致对大亚基基因的提取及顺序分析。他对RuBisCo的功能,结构,遗传以及进化的研究有着世界公认的贡献,为表彰他在这方面的贡献,他获得杰出成就奖(Award of Distinguished Achievement-1979),Fulbright奖(1983),复旦大学聘为名誉教授(1986),并为美国科学院选为杰出学者(1980)。
孔教授第二方面的主要成就在于他对叶绿体基因的分离分析,并能用来研究其遗传及进化,它与同事们首先研究了四十多种菸草,谱出了第一个在分子水平上进化的过程,回答了很多昔日难以回答疑难问题,并被其他学者套用为研究分类和进化的指标,他这项重大的贡献,有目共睹,其母校中兴大学及母係为其杰出成就颁予杰出成就奖(1990),杰出系友奖(1992),和杰出校友奖(1993),同年选为New York Academy of Sciences会员。
除了以上成就和获奖之外,世界各国为表扬其杰出成就,将他列入使多种名人录,其中两种在中国出版(Who's Who in the World,Who's Who in America,Who's Who in the East,Who's who in Frontier Science and Technology,Who's Who in Science and Engineering,Who's Who in Medicine&Healthcare,Who's Who in Biotechnology Today,Who's Who in Society,Who's Who in American Education,Who's Who in Overseas Chinese,Who's Who Among Asian America,Who's Who of Intellectuals-International,American Man and Women of Science,Directory of and Technology,Who's who in Society )。
一九八七年受美国科学院(U.S.National Academy of Sciences)之託和中国科学院邀请调查中国生物工程开发状况,并访问北京、天津、上海、广州等二十多所学校和研究所,所调查结果由the Committee on Scholarly Communication with the Pelple's Republic of China 出版为"Biotechnoligy in China",现已发行二版,为目前对中国生物工程研究最早最有系统而又最具权威的着作。