该线路联络北京周边卫星城；同时在磁各庄站可与北京捷运新机场线换乘，还设有支线前往首都机场，间接起到联络首都两大机场的作用。

经过多次调整线路规划，根据最新发改委十三五轨道交通规划方案（2015-2021）。目前确认S6为老机场（顺义）和新机场（大兴）联络线，原有牛栏山、马坡站确认取消。

2016年5月，人民网报导，连线新老机场的北京城际联络线S6线的设站情况在部分招标网站公布。此次招标主要为S6线车站周边土地综合利用研究而设。招标信息显示，S6线初步考虑全程设站17座，其中北京境内15座，廊坊境内2座。

在全程17座车站中，通州与大兴所设站点最多，达到7站。其中顺义设1站，为北部起点首都机场T3站，另在张辛线路所预留1站。通州7站包括徐辛庄站（即规划平谷线宋庄站）、潞苑南路站（即规划R1线龙旺庄站）、新华大街站（即6号线暂缓开通的通运门站）、新北京东站、万盛南街西口站、亦庄火车站、马驹桥站。大兴7站包括采育站、新航城站、新机场站、开发区西站、磁各庄站、瀛海站、黄村火车站。廊坊境内2站为廊坊东站、空港新区站。

根据招标信息公布的内容，S6线未来有望与10条轨道交通线路实现换乘，包括4号线、6号线、7号线、8号线、19号线、亦庄线、机场线、新机场线、平谷线及R1线。

2017年11月，人民网报导显示，按照最新规划，S6线会单独保留，城际联络线不再分成两支，将从亦庄直接到新机场。这也就意味着，城际铁路联络线将直接连线首都机场、北京城市副中心、环球主题公园和北京新机场。