本菌为0.8mu×1.2~1.4mu革兰氏阴性桿菌，细胞椭圆形或短桿状。绝对好气性的桿菌。形成孢子，鞭毛着生，无运动性。在pH3.5也能很好地生长，具有形成薄皱菌膜性能。产醋力在6%左右，并伴有乙酸乙酯生成，增进醋的芳香，缩短陈酿期，但它能进一步氧化醋酸。

巴氏醋酸菌在高温下会由短桿状转为纺锤状、丝状或链状。

能与许氏醋酸菌、恶臭醋酸菌、纹膜醋酸菌等一起参与醋的酿造。