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ssh(抑制性差减杂交)

ssh(抑制性差减杂交)

抑制性差减杂交( suppression subtractive hybridization, SSH),抑制性差减杂交( SSH) 是1996 年由俄国科学院、加州大学旧金山分校和CLONTECH 公司联合开发的技术。

抑制性差减杂交( suppression subtractive hybridization, SSH),抑制性差减杂交( SSH) 是1996 年由俄国科学院、加州大学旧金山分校和CLONTECH 公司联合开发的技术, 它能够快速、简便地分离和鉴定不同细胞系、不同组织或同一细胞系、同一组织在不同条件下的差异表达基因。
SSH 技术的主要原理是以抑制性PCR 为基础的cDNA 差减杂交。当使用与2 个不同接头序列互补的引物进行PCR 扩增时, 无差异表达基因的cDNA 由于两端存在着反向重複序列, 退火过程中容易产生类似髮夹的互补结构, 无法作为模板与引物配对,从而达到选择性地抑制非目的基因的扩增, 而差异表达基因的cDNA 则可以有效扩增的目的。同时,运用杂交二级动力学原理, 使得在丰度上有差别的单链cDNA, 在变性后再复性的过程中达到均一化富集, 从而消除目的基因间的丰度差异。
SSH 技术操作的流程如下: ①分别提取2 种不同细胞( 受试方: Tester; 驱动方: Driver) 的mRNA并反转录为cDNA; ②分别用RsaI 酶切割处理后,将Tester cDNA 分为相等的2 份, 并与2 个不同序列的接头连线; ③将上述加接头的cDNA 分别与过量的Driver cDNA 混合, 变性后退火杂交; ④两轮抑制性PCR 扩增与接头相连的Tester cDNA 分子; ⑤PCR产物克隆纯化, 构建差减文库并对文库进行筛选、验证。

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