在火星的阿路巴市，2071年的万圣节前，一个名叫Vincent的手臂上有纹身的不明人士在一号公路上炸毁一辆油罐车，并释放出和人体淋巴球相似的纳米机器人（这种淋巴球纳米机器人被设计成经由氧气传播进入血液并且自我複製依附在人体淋巴上最后进人人体大脑并杀死寄主，然后自我毁灭排除体外）。事件造成大量人员的死亡，医院由于不知道这种生化武器相关内情二束手无策。ISSP（火星警察机构）不得不作出对此次事件的悬赏，以求火星各位赏金猎人共同抓住Vincent ，赏金高达3亿乌龙（动漫中设定的钱币单位）。Spike等人从电视节目上得到此讯息，决定接手此案，努力查出兇手，获得赏金。在整个查案过程中暴露出Vincent另一个助手Lee，他是一个电脑黑客，协助Vincent在电视上传播关于他策划的生物袭击。由于準备不足加上线索太少。Spike和Faye分别从两方面入手调查，Spike通过摩洛哥大街意外结识了一位叫做拉希德的神秘人物。他想通过拉希德问出卡车爆炸案中到底释放了什幺。神秘的拉希德以一种很隐蔽的方式给了Spike一粒小球（外形像玻璃球，每一颗中有三万个纳米机器人）。ED和Jet通过这粒玻璃球查出了其中含有纳米机器人这种非法的生物武器。并通过曾近的同事Bob问出了一家神秘的药物生产公司（实际是政府军队生化武器生产基地，以药物公司隐藏耳目）。由于涉嫌政府，Spike在潜入药物公司调查时遭遇了不顺，并遇到了药物公司中的一位女职员艾蕾卡（手臂有着和Vincent相同纹身），由于艾蕾卡的谨慎看出了Spike是潜入调查，因此spike并未查出什幺就不得不落荒而逃。但是机智的Spike在艾蕾卡身上留下了定位偷听器。于此同时Faye在游戏厅抓捕Lee也遭遇不顺，让Lee逃脱。之后在Vincent被药物公司查出位置，準备出击抓捕。Spike通过窃听器得到讯息，也参与其中。由于艾雷卡和Vincent曾近隶属于同一只部队（火星特殊部队第七队，也是纹身相同的原因），艾雷卡想自己解决，命令手下等待。这给了spike介入的机会。经过一番周折Spike终于在Vincent乘坐的高空轨道列车与Vincent相遇。并发生枪战和搏斗，结果是Spike甘拜下风，被打伤并被Vincent扔出窗外，掉入海中。于此同时艾雷卡冲进车厢 但是Vincent利用手榴弹再次引爆纳米机器人。爆炸过后车厢中人员基本死亡，Vincent消失不见，车厢中只留下了不知为何没有中毒死亡艾雷卡。生化武器生产基地的司令官认定此事蹊跷，让内部人员监视受伤回来的艾雷卡。Spike则在沉入大海后被以为印第安酋长（TV版多次出现）解救。受伤回去的Spike'不甘放弃，回去后再次以药物公司入手，让ED通过黑客方法查出了药物公司的原本面目（政府的生化武器生产基地），并查出了博士曼德拉这个发明此生化武器的人。Faye通过ED和小狗的帮忙在调查Lee的过程中发现了Lee住处的大线索，并单枪匹马準备实施抓捕，但是在抓捕过程中偶遇Vincent利用生化武器杀死Lee这个同犯以灭其口的场面，Lee当场死亡，Faye也因进屋被纳米机器人感染，晕倒在地。于此同时Spike决定再次进入摩洛哥大街，寻找拉希德这个神秘人士，想通过他得知更多的内情。拉希德将Vincent的故事经历整个告诉了Spike，Vincent曾隶属于泰坦星特种部队，由于政府研究纳米机器人，成为为人体试验品。由于疫苗的研究在他体内成功活了下来，但是失去了大量战友和同伴，同时由于药物刺激失去了大部分记忆。陷入精神的混乱并因此想报复世界，利用这种生化武器来毁灭世界。由于这种武器研究时间已久远，药物公司销毁大部分资料，并想将此事从此抹灭，并没有留下疫苗等研究资料，所以对于Vincent的生物袭击才会束手无措。拉希德也表示出自己其实是曼德拉的原本身份，因为自己发明了恐怖生化武器而内心谴责，毁灭所有资料逃出军队隐居在摩洛哥街。Faye在中毒之后却意外清醒但是手脚都被绑，因为被Vincent将自己血中的疫苗给了她，内心恍惚的Vincent将自己的故事讲给Faye。就在这个时候，意外发生了，由于纳米机器人事件的传播，药物公司动用军队开始对相关人员实施抓捕，想方设法隐藏生化武器的秘密。艾雷卡因身体内有疫苗而被抓获，Spike在和曼德拉谈话过后也被抓获，曼德拉成功逃脱。艾雷卡表示疫苗可以帮助那些事件中的患者，但是司令官的解释是这件事就不该存在，因此所有知道此事的人物也都必将会被政府灭口。在监狱中，艾雷卡和Spike敞开心扉，艾雷卡表示她一直喜欢着Vincent所以希望能够救赎他。两人通过手段越狱而出，并带走了正在複製的有着疫苗的艾雷卡的血液。Vincent因为万圣节已到，决定通过万圣节的狂欢实施纳米机器人的袭击。艾雷卡和Spike交给Jet通过飞机喷洒这种疫苗準备解救阿尔巴市的人民免受生化袭击。随后Spike便来到了铁塔上与Vincent再次交手。双方最后终于筋疲力尽，艾雷卡赶到现场，掏出手枪準备和Vincent同归于尽，但不料Vincent没有开枪，决定自杀，最终在死前记起来艾雷卡并表示自己爱她，整个故事也在此结束了。

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