1940年代初期，加拿大太平洋铁路于短时间内收购了10间荒野航空公司，在1942年收购西加拿大航空后，成立了加拿大太平洋航空公司。曾长时间与公营的环加拿大航空（即现时的加拿大航空）竞争。
该公司当时是加拿大的海陆空交通集团CanadianPacific的子公司，它在中国的名称是“昌兴轮船”，因此，加拿大太平洋航空当时又被中国人称为“昌兴航空”。
该公司曾经被恐怖份子M.Singh先生（简称，其后证实是假名）利用，于1985年的6月22日，使用该公司的60号班机来运送他装着炸弹的行李，最后就造成了印度航空182号班机空难。