其主要程式是：(1) 依据上级部署和本单位具体情况，拟订审计工作计画，报经本单位领导批准后，制订审计方案，进行审计工作。(2) 对审计中发现的问题，可随时向有关单位和人员提出改进意见。审计终了，应提出审计报告，在徵求被审计单位的意见后，报送本单位领导，重要的应同时报送同级国家审计机关。(3) 对重大审计事项作出的处理决定，须报经本单位领导批准。经批准的处理决定，被审计单位必须执行。(4) 被审计单位对处理决定如有异议，可在15日内向本单位负责人或上级内部审计机构提出申诉; 对部门内部审计机构的处理决定如有异议，可向部门负责人提出申诉。单位负责人、上级内部审计机构和部门负责人，应在接到申诉30日内作出处理，对不适当的处理决定予以纠正。申诉期间，原审计处理决定应照常执行。