西南科技大学生物科学实验中心是在原有生物技术实验中心及食品製药系、农学系、生物技术与工程系等专业实验室的基础上于2004年7月组建的，由实验室和教学实习基地组成，是开展实践教学、培养学生操作技能和锻鍊动手能力的主要场所。现有专兼职实验室管理及教学人员48人，其中教授11人、副教授36人、高级实验师1人，具有硕士以上学位38人。主要为本科实验教学、学生课外科研、毕业实习、研究生课程实验及论文工作、教师科研工作等提供服务。同时也面向全校和社会开放，积极开展各种分析检测、技术谘询和技术培训服务。
西南科技大学生物科学实验中心主体部分位于学校新区东7A座和E座，设有生物显微观察实验室、生物形态解剖实验室、细胞与遗传实验室、微生物实验室、生物化学实验室、分子生物学实验室、生物分析测试实验室、植物生理生化实验室、植物细胞工程实验室等生物学基础公共实验平台，建有生物工程实验室、食品工艺实验室、动物学基础实验室、药理生理实验室、製药工艺实验室、设施农业实验室、农业气象观测实验室等专业实验室，用于本科教学的各类实验室共17个。以植物学科为核心建有资源植物生理研究室、作物遗传与分子生物学研究室、植物细胞工程研究室、植物天然产物研究室、药用植物研究室、核辐射生物效应研究室、生物质化学衍生物研究室等13个实验室。
西南科技大学生物科学实验中心室内外实验总面积约8300平方米，现有各类设备总数2000多台套，设备总额约1800万元，拥有高效液相色谱仪、携带型光合仪、倒置显微镜、正置萤光显微镜、凝胶成像系统、双光束红外分光光度计、紫外可见分光光度计、原子吸收分光光度计、全自动微生物发酵罐、全自动微生物分析系统、高速冷冻离心机、梯度PCR扩增仪、超低温冰柜、全自动高压消毒器、核酸蛋白测定仪、超音波细胞破碎机、中药分离纯化系统等精密仪器。