医院设临床科室30个，医技科室10个。其中，国家临床重点专科（中医专业）7个（脑病科、推拿科、心病科、肺病科、儿科、内分泌科、药学部），国家中医药管理局重点专科13个（脑病科、心病科、眼科、骨科、肛肠科、儿科、推拿科、肺病科、内分泌科、肾病科、耳鼻喉科、预防保健科、急诊科），省卫生厅重点专科3个（脑病科、针灸科、推拿科），省中医药管理局重点专科18个（肺病科、肾病科、糖尿病科、肝脾胃病科、老年病一科、老年病二科、风湿科、肿瘤血液科、针灸科、耳鼻喉科、妇科、皮肤科、乳腺科、护理、药剂科、预防保健科、外二科、附属经开医院脑病康复科），吉林省重中之重学科1个（中医学），国家中医药管理局重点学科15个（中医脑病学、中医心病学、中医肺病学、中医骨伤科学、推拿学、针灸学、中医儿科学、中医眼科学、中医耳鼻喉学、中医神志病学、中医全科医学、中医络病学、中医预防医学、中医康复学、中西医结合临床），省教育厅重点一级学科2个（中医学、中西医结合），省中医药管理局重点建设学科12个（中医内分泌学科、中医肛肠学科、中医康复学科、中西医结合临床学科、中医儿科学科、中西医结合基础学科、中医眼科学科、中医皮肤病学科、中医肾病学科、中医妇科学科、中医痹病学科、中医养生学科）。

医院开放床位1635张，配备SPECT、核磁共振、CT、DR、数字胃肠机、全自动生化分析仪、免疫分析仪、彩色都卜勒超声诊断仪、电子纤维窥镜、多参数心脏监护系统、血液透析机、体外冲击波碎石机、微波治疗机、都卜勒诊断仪、眼底氩雷射仪、前列腺气化电切镜、超声聚焦刀等医疗设备。

2018年12月7日，国家卫生健康委公布全国援外医疗工作先进集体名单（共29个），长春中医药大学附属医院在其中。

吉林省长春市工农大路1478号。