蓝伯雄教授曾在《中国管理科学》、《运筹与管理》、《清华大学学报》、《计算机集成製造系统》等重要学术期刊上发表数十篇学术论文，主持多项国家自然科学基金重点、面上项目以及政府、企业合作项目。

蓝伯雄教授在多个学术组织中任职，包括北京运筹学会副理事长、中国电子学会高级会员、中国电子学会工业工程分会副理事长、中国运筹学会常务理事、中国优选法统筹法与经济数学研究会理事等，同时担任北京华胜天成科技有限公司独立董事、北京神州泰岳股份有限公司独立董事，并承担一些公司和政府部门的谘询和研究工作，如：中远集团，北京控股有限公司，SAP公司，ILOG公司，中国教育部，中国铁道部，易程股份，中国国际航空公司等。曾与1989年至1990年在加拿大滑铁卢大学做访问学者。