《温州医科大学学报》是由温州医科大学主管、主办的综合性医学学术期刊。

1959年10月，《温州医学院校刊》创刊；1960年，更名为《温州医学院学报》；2013年，更名为《温州医科大学学报》。

据2018年4月《温州医科大学学报》编辑部官网显示，《温州医科大学学报》编辑委员会拥有编委108人，顾问6人。据2018年4月中国知网显示，《温州医科大学学报》共出版文献7238篇、总被下载345990次、总被引13946次、（2017版）複合影响因子为0.564、（2017版）综合影响因子为0.449。据2018年4月万方数据知识服务平台显示，《温州医科大学学报》载文量为4521篇，被引量为10692次，下载量为95381次；2015年影响因子为0.76。