在精灵宝可梦：无印篇第74集 “ 激烈冲突，超古代神奇宝贝 ” 中，超古代神奇宝贝首次登场。火箭队的捣乱导致超古代神奇宝贝解除封印，超古代耿鬼与超古代胡地进行争斗，超古代胖丁制止了它们。

游戏中与野生的超古代神奇宝贝对战会有特殊的对战开始画面，是三者身上的花纹或含有红色背景Ω字样/蓝色背景α字样/绿色背景的宝石的稜角纹理。

红蓝宝石

盖欧卡和固拉多会依与之对应的游戏中分别出现在觉醒祠堂。进入殿堂后，烈空坐会出现在天空之柱顶层。

绿宝石

从送火山夺走蓝色宝珠和红色宝珠后，火岩队和水舰队分别在火岩队本部和海底洞窟唤醒固拉多和盖欧卡。当两只神奇宝贝都被唤醒后，会在琉璃市决斗，造成丰缘地方东部地区的异常天气。主角的任务就是到天空之柱召唤烈空坐制止它们。事件以动画方式进行，这是主系列游戏中首次在剧情中出现动画，事件结束后烈空坐会再次回到天空之柱顶层，可以捕捉。

进入殿堂后，盖欧卡和固拉多将分别栖息在海之窟和陆之窟，可以从天气研究所得知天气异常的地点，以确定海之窟和陆之窟出现的地点。

心金魂银

超古代神奇宝贝栖息在埋藏之塔。进入殿堂之后还需要另外四条件：打败小智、从大木博士处升级全国图鉴和得到关都的初学者神奇宝贝、从神奇宝贝爷爷处对应宝珠。

心金版能得到蓝色宝珠捕捉盖欧卡；魂银版能得到红色宝珠捕捉固拉多。

将在埋藏之塔捕捉的盖欧卡或固拉多同时展示给大木博士后，大木博士会赠与绿色宝珠。再次来到埋藏之塔，便可以捕捉烈空坐。

终极红宝石/始源蓝宝石

固拉多、盖欧卡与红蓝宝石版相同，不同的是出现时为回复原始状态。 裂空座则是在变化篇章剧情中必须捕获的神奇宝贝。

在路比小时候，烈空坐被神奇宝贝联盟所捕获并且进行研究，不料儿时的路比间接将烈空坐放走。路比的父亲千里只好独自背负罪行，尝试将烈空坐寻回。

路比11岁的时候，火岩队与水舰队联手进入海底洞窟分别唤醒了固拉多与盖欧卡。两只神奇宝贝到琉璃市进行生死决战，对整个丰缘地方都造成了天灾。为了制止固拉多与盖欧卡，千里和小光去天空之柱，释放出烈空坐。固拉多与盖欧卡在宝珠和烈空坐的威压之下停止了战斗。烈空座返回天空之柱。固拉多前往烟突山内进行沉睡。盖欧卡返回海底洞窟进行沉睡。