在这些工厂中，最特别的当属核糖体，这种大规模的分子机器存在于所有的活体细胞之中。而此次的分子机器研发正是基于核糖体。它的突出特色是具有一个功能化的纳米环，其能在分子轨道上移动，并拾起轨道上的构建模组，且以特定的顺序将它们连线在一起，以合成所需的新分子。

首先，纳米环会穿过分子链并藉助铜离子开展装配过程。随后，一个“反应臂”将被附着在机器的剩余部分并开启操作。纳米环会沿分子链上下移动直至被前方的构建模组挡住去路，之后“反应臂”将从轨道上卸除这一障碍，并将其传送至机器上的另一位置，激发“反应臂”上活性部位的活力。这样纳米环就能自由沿分子链移动，直到遇到下一个构建模组。如此反覆，就能在纳米环上构建出新的分子结构。当所有的构建模组都从轨道上移除时，纳米环的去分子链和合成过程便会结束。

研究人员指出，製造出的原型机器远没有核糖体那般高效。核糖体能够在1秒内连线20个构建模组，连线上限多达150个。而当前他们仅用分子机器连线了4个模组，连线每个模组更要耗时12小时。但科学家指出，可以大规模并行推进这样的装配过程，其已经在实验室内使用百万万亿（10的18次方）架同样的机器并行实现了分子的构建。
戴维·利说指出，下一步他们会致力将更多的构建模组囊括其中，以利用人造分子机器製造出更複杂的分子，也有望打破自然和现有合成方式的局限，构造出全新类型的分子。