余依婷出自宁波市游泳训练中心镇海训练点的游泳小将，省队队员。在2015全国少儿游泳锦标赛上，共获得3金1银1铜——50米和100米蛙泳第一名、蛙泳全能第二名、200米混合个人游第三名、集体4×50米混合泳接力第一名并破年龄组全国纪录。

2017年8月，第十三届全运会青少年组游泳比赛，宁波游泳训练中心女选手余依婷、张雯雯入围参赛，其中余依婷获得女子11-12岁组蛙泳全能冠军和200米自由式亚军。

2018年6月24日中午，2018年全国夏季游泳锦标赛，女子100米蛙泳预赛，浙江队余依婷以1分10秒33排名第一。

第十六届省运会游泳比赛在湖州市奥体中心拉开帷幕，女子13岁组4×100米混合泳，宁波队余依婷、林佳雯、陈雨彤、戴梓澜夺冠。13岁组4×100米男女混合泳接力比赛中，余依婷、刘海洋摘得金牌。

2018年10月14日，以2分15秒10的成绩获得2018全国游泳锦标赛女子200米混合泳亚军。

2019年全国青年游泳锦标赛暨青运会预选赛在辽宁瀋阳结束。余依婷在女子乙组200米蛙、200米混、100米蛙和400米混项目中，斩获4枚金牌，并在女子乙组50米蛙竞赛中获得1枚银牌。

2019年6月13日，2019年全国夏季游泳锦标赛，女子50米蛙泳，2005年出生的浙江小将余依婷以31秒76封后。

2019年7月8日，中国游泳队公布2019年游泳世锦赛参赛名单，余依婷入选。

2019年7月28日，韩国光州举行的2019国际泳联世界游泳锦标赛女子400米混合泳预赛中，余依婷以4分42秒52的成绩位列第14，无缘决赛。