2005年，毕业于复旦大学历史地理研究中心，曾担任厦门大学人文学院历史系副教授、专门史教研室主任，2015年起担任厦门大学人文学院历史系教授。

着有《关山迢递：河陇历史文化地理研究》（2011年，上海人民出版）。在《中国史研究》、《学术月刊》、《历史地理》、《清史研究》、《中国历史地理论丛》、《复旦学报》、《厦门大学学报》、《人文地理》、《海洋史研究》等期刊发表论文多篇，部分论文被《中国社会科学文摘》、人大複印报刊资料《先秦、秦汉史》、《魏晋南北朝隋唐史》、《地理》、《宗教学》等刊物所转载。

国家社科基金项目《明清时期西北太平洋热带气旋与东南沿海基层社会应对机制研究》以及福建省新世纪人才项目。曾主持宁夏自然科学基金项目、教育部基础教育研究中心课题、福建省社会科学规划项目各一项。

入选福建省新世纪优秀人才项目。曾获中国地理学会优秀辅导教师、银川市首届青年科技明星、宁夏教育厅教育科研先进个人等荣誉。论文曾获全国本科生学术论文邀请赛一等奖(南京大学地理系、江苏省地理学会主办），宁夏回族自治区大学生挑战杯一等奖，宁夏回族自治区自然科学优秀学术论文二等奖一项、三等奖二项，宁夏回族自治区教育厅教育科研成果奖一等奖，银川市教育科研优秀成果一等奖。厦门市社会科学优秀成果奖四项，福建省社会科学优秀成果奖二项。

在学生眼中，李智君老师是一个谦和幽默的人，上课认真负责，生动不枯燥，老师对待教学认真负责，语言生动，条理清晰，举例充分恰当，对待学生严格要求，能够鼓励学生踊跃发言，使课堂气氛比较积极热烈。 课堂内容充实，简单明了，使学生能够轻轻鬆鬆掌握知识。 教学内容丰富有效，教学过程中尊重学生，有时还有些幽默，很受同学欢迎。