南关为古代军事战略、海上交通要地，归属浙闽两省共管。明嘉靖二年（1523），为防御倭寇入侵内地，在南关设定镇守。清朝亦驻水兵巡防。每逢农曆五月十八日，温州、福宁两府总镇亲率部属于此会哨。岛上筑建5座烟墩，发现敌情即放烟火为号，以告驻军武装抗御。清光绪元年（1875），浙江温州和福建建宁两总镇会于此岛山腰同立《闽浙界牌》：“稟奉宪示设立南关山界碑。界南闽福鼎县武辖烽火营。北属浙江省平阳县武辖瑞营。并于该山各建营房、派弁兵长川驻守，以昭严密。”1930年，南关界北设保，隶属平阳县霞关镇，南关界仍属福鼎辖地，各亦常驻防军。1949年后，根据海防形势需要，断续驻有中国人民解放军部队，至1985年撤防后，继由海岛民兵组织防守，并设民兵哨望所。

相传，明朝后期一个名叫孔穆的老太婆，悄然来到南关，见宿于界北的破旧营房。后来移居岛上营房的人逐渐增多，形成营房脚（界北）、粗糠柴脚（界中）、走察（界南）3个自然村。村民勤劳俭朴，通用闽南话。居民有回族和汉族，姓氏有林、李、章、徐、陈、董、肖、王、朱等，都是在清末军阀混战时，为了逃避战乱和苛捐杂税来到海岛的。村民不分姓族，重情谊，和睦相处，风气良好。1949年以来，在海洋捕捞中，没有发生过不安全事故；在地方邻舍间，没有出现过宗族纠纷。军民亲密无间，干部村民同心，共为岛屿的文明建设尽劳出力。在经济建设上，南关村村民出资出力，投入生产和生活上的基本建设，岛貌焕然一新。10年里无民事纠纷，无刑事案件，无聚众赌博，无吵架殴斗。即使两夫妻发生口角吵场，一经村干部出面调解，即言归于好。1984年县人民政府授予"文明建设先进村"的称号；1985年和1986年，县人民政府和温州市人民政府，分别命名南关为“文明村”和“文明岛”。

南关岛自从有人群居开始，便以渔业为主兼及农业。但长期间渔具简陋，只能靠拾贝类、捕小鱼和晒制虾皮，百多户人家仅种百余亩山园。1949年后的30多年，虽逐渐摆脱贫困，但仍未尽得山海之利。直至80年代，村民生活才得到改善。孤岛荒村面貌才得到改观。南关村开始成为引人注目的一颗海上明珠。新建的一条长达2.2公里、宽2.5米的交通大道，沟通岛屿南北；一座交通码头，接送着海上往来的商客；两座渔用码头，日夜忙着收接满载而归的大小渔船。横跨霞关--南关、接通华东邮电网的输电线路工程和自来水建设，结束了岛屿无电的历史，解决了村民饮用水问题。此外，南关办成完全国小，建有崭新的教学楼和教师宿舍，解决了村民子女上学难的问题。全村学龄儿童123名全部上学，分国小5个班和幼稚园一个班。教学质量较高，学生成绩优良，教师朱成準被评为1989年中国优秀教师、市劳动模範，曾出席在北京召开的中国优秀教师会议。办有渔民俱乐部，使村民有了业余文化娱乐的场所，居民房舍拆旧换新，倚山面海，层层叠叠形成阶梯型建筑。

南关人打破旧的单一渔业生产方式，实行渔汛季节更替捕捞，採用大网、流刺、鹰捕和定量等作业和技术，不断改革创新，获得效益后，又投入渔业建设，扩大再生产。南关村有42艘吨位在15吨以上的机动渔船。其中，80～150马力的有25艘，每船都安装安全生产对讲机，部分船只并装有捕捞机械。1992年，渔民劳力147个，年渔业劳力人均收入超万元。南关村年人均收入达2500元以上。

南关海产丰富。其中传统特产“蒲门吹”（吹虾或虾皮）闻名遐迩。“浦门吹”具有水分少、含盐量低，色鲜味美、体型大而完整，张板清而肉质厚实，存放时间长的特点。每百克含钙1000毫克，并富有碘和肝糖，既是餐用佳肴和佐料，又可作防治小儿佝偻病的药物。虾皮年产2000吨、产值80万元，畅销于大陆和香港、台湾，还远销于美国、日本。南关于1992年6月经批准为对台贸易开放岛屿，有一批批外来商客来此洽谈开发、开放事宜。南关气候独特，夏无酷暑，冬无严寒，实乃旅游、度假、避暑、疗养之地。岛上有烟墩遗蹟，有纵横交错几里长的旧战壕等。岛外大海汪洋，海鸥上下飞翔，巨浪汹涌呼啸。

架设1条4公里长的高压线路，户户装上电灯，结束了“火篾油灯照明”的历史。自然村先后装上自来水，解决了村民的饮水卫生问题。1987年筹集4万多元，作为23岁以上村民的养老基金。每年拨款7000多元，作为60岁以上老人的生活困难资金，每人每月15元。