1989年11月，广东省人民政府批准建立担桿岛猕猴省级自然保护区。
1990年6月，成立珠海市担桿岛猕猴保护区管理站，由市绿化委员会管理。
2000年4月，珠海市人民政府批准成立“淇澳红树林保护区”，由淇澳管理区管理。
2002年2月，市林业局正式接管淇澳红树林保护区，担桿岛省级自然保护区由市野生动植物保护管理站接管，卢海洋站长兼管全面工作。
2004年11月，广东省人民政府批准同意将淇澳岛自然保护区和担桿岛省级自然保护区合併，建立“珠海淇澳—担桿岛省级自然保护区”。

2006年1月，珠海淇澳—担桿岛省级自然保护区管理处筹建正式完成，并独立办公。

淇澳岛红树林自然保护区，位于广东省珠海市淇澳岛西北部，地理位置居于东经113°36′40〞~113°39′15〞，北纬22°23′40〞~22°27′38〞之间，东南、西南与该岛大澳围、东涌、西涌、石井湾接壤，西北及东北与中山、深圳、香港隔海相望，总面积5103.77公顷。

担桿岛自然保护区，位于珠江入海中，北距香港、深圳分别为20km和78km，西北距澳门、珠海分别为72km和74km。地理位置在东经114°07′~114°19′，北纬21°58′~22°04′。包括担桿岛、二洲岛，总面积2270公顷。

主要保护对象为红树林湿地、猕猴、鸟类及海岛生态环境,是研究湿地生态系统、候鸟以及猕猴原生地和发展史的重要基地。

淇澳红树林保护区内拥有维管植物165科470属695种（野生植物140科398属556种，栽培植物65科106属139种）。在野生维管植物中，其中蕨类植物19科28属39种；裸子植物3科3属4种，被子植物118科367属513种。其中红树植物达10科13属15种，分别占中国现有红树科、属、种的83.3%、86.7%和55.6%；半红树植物达7科9属9种，分别占中国现有半红树科、属、种的77.8%、90%和90%；红树林伴生植物为11科15属15种，分别占中国红树林伴生植物科、属、种的73.3%、71.4%和68.2%。
担桿岛猕猴保护区内拥有维管植物438种（含9变种），分隶320属123科。其中蕨类植物22种，分隶18属17科；裸子植物7种，分隶5属5科；双子叶植物342种8变种，分隶250属86科；单子叶植物58种1变种，分隶47属15科。属国家3级重点保护植物有土沉香、吊皮锥和白桂木三种。

淇澳岛：区内拥有底栖动物103种，隶属5纲，14目48科；鱼类90种，隶属10目，41科；陆生脊椎野生动物154种（含两栖动物15种，爬行动物27种，鸟类99种，哺乳动物13种）隶属25目，58科。属国家重点保护动物（珍稀濒危动物）15种，占广东省珍稀濒危动物总数（117种）的12.8%，其中国家一级重点保护动物有1种，二级重点保护动物14种。
担桿岛：区内拥有野生动物85种，分隶34科、19目。其中兽类10种；鸟类60种；爬行类10种；两栖类5种。属国家1级重点保护动物有蟒蛇1种；国家2级保护动物猕猴、穿山甲、松雀鹰、雀鹰、鸢、褐翅鸦鹃、长耳鸮和虎纹蛙等9种。

珠海淇澳—担桿岛省级自然保护区与中国林科院热带林业研究所合作申报的国家科技部农业科技成果转化资金项目《红树林湿地植被快速恢复技术套用示範》和国家“十一五”科技攻关项目专项《华南沿海红树林保护与恢复重建技术试验示範》最近已获得国家科技部批准，项目即将在淇澳岛红树林保护区全面展开。