土壤生物多样性，是指土壤生物及其所组成的系统的总体多样性和变异性。包括遗传多样性、物种多样性和生态系统多样性等，涉及土壤中多种多样活的有机体（动物、植物、微生物）的种类、数量及其在土壤中的分布信息。土壤中生活着脊椎动物、无脊椎动物以及肉眼看不见的各种原生动物、藻类、真菌、细菌和放线菌等丰富的生物类群。