据台湾媒体报导，国民党主席马英九承诺2006年“329青年节”要成立的青年团，总团长任期1年不得连任；选举采纯公办竞选，候选人经费上限20万新台币；需花6个星期、每星期3天集体参与公办竞选；不得自行出选举广告、筹办或出席募款餐会；全部依赖内部安排裁培，青年团经费来源短期由国民党支应，中长期要自辟财源，与党产分离管理，仅监督但不支应。国民党青年团章程与总团长选举办法于2005年12月14日中常会里提出审议、通过，不论是章程或是选举办法，规定均十分严谨，几乎完全脱离现行政府所定公办选举的模式。

国民党青年团筹备单位希望，2006年329成立目标为全台400个分团，其中60个分团为学青，340个为社青。青年团将来成立，在国民党的组织定位为直属中央委员会，为国民党内一级机关。总团以下，设有学青及社青两种不同性质的支团，支团必需由3个分团组成一个支团，每一个分团必需有90人，其中1/3必需是国民党员。青年团组织架构，不仅有总团长，也另设导师团总召及导师，将来还要给创办人马英九定位终身荣誉职。青年团又直属党主席马英九，总团长即未来的青年副主席，位阶高于秘书长詹春柏，而国民党党工，也逐渐雕零、精简。青年团章程内容严谨，入团资格为15岁以上、40岁以下，成员一旦届满40岁，隔一个月即自动离团。总团长任期一年，不得连任；就连青年团长的选举办法，都采高规格，选举为纯公办竞选。

2007年6月5日，中国国民党第17届第2次全国党代表大会追认通过。

2007年7月4日，据台媒报导，中国国民党中常会修正通过“中国国民党青年团章程”，国民党发言人苏俊宾说，未来团员限定为在学青年，年龄限制在40岁以下，总团长将于2007年7月28日改选。

国民党中常会当日下午举行，苏俊宾在会后指出，国民党预计2007年7月底进行青年团总团长改选。另外，根据国民党党章修正案第22条第2款规定“指定常务委员一人，由青年团总团长担任之”，因此，青年团总团长将是指定中常委。根据与会人士表示，青年团章程修订过程中，虽然青年团总团长林益世三个月来巡迴全省宣传改组理念，但各地仍有社会青年感到不满，甚至传出黑函、攻讦言语。中常会中有多名中常委声援林益世，中常委连胜文、吴志扬等人都认为，林益世为了服务青年团，连自己在高雄县的选区都被迫暂放一边，如果连这样都还要被部分有心人士攻击，实在很不公平，希望大家给他掌声。林益世说，他的任期到新的总团长当选后告一段落，风风雨雨他都不会计较，做好工作比较重要。国民党主席吴伯雄最后裁示，往后青年团专属在学青年，而社会青年部分则将请各县市党部积极联繫，全数纳入青工总会、党中央青工部，继续发挥功能。

第一条（法源）

本章程依据中国国民党党章第二十三条之规定订定之。

第二条（名称）

本团名称为中国国民党青年团（KUOMINTANG YOUTH LEAGUE）， 简称青年团（YOUNG KMT），以下简称本团。

第三条（宗旨）

本团为凝聚在学青年活力向心，培养中国国民党（以下简称本党）及国家人才，以推动改革、创造机会、实践理想、相互学习、服务社会及发扬博爱精神为宗旨之学生青年团体。

第四条（任务）

本团之任务如下：

一、保障在学青年权益，扩大社会参与，推动相关法规制度之建立与修正。

二、建立公开机制，举用在学青年干部，参与本党决策，为国家培育全方位的青年领袖及政治人才。

三、提供在学青年公平、多元、充分的教育训练，并创造青年实现自我的机会。

第五条（组织定位）

本团隶属本党中央委员会，应受本党中央委员会之指导、监督。

第六条（入团资格）

凡赞同本团宗旨，年满十五岁以上，四十岁以下之中华民国国民，且为在学学生，亲自填具入团申请书，经本团审核通过，并缴纳团费者，为本团团员，其详细办法另订之。

第七条（团员权利）

团员享有发言权、提案权、表决权、选举权、被选举权及参与本团活动等其他法定应享之权利。

第八条（团员义务）

团员有遵守本团章程、决议、缴纳团费之义务。

未缴纳团费者，不得行使前条之权利，经书面催缴三十日内仍未缴纳时，丧失团员资格。

第九条（团员处分）

团员有违反法令、章程或不遵守本团决议时，经本团执行委员会决议，予以警告或停权之处分，其危害团体情节重大者，予以除名。

第十条（离团）

团员年龄超过四十岁，或因毕业、退学或其他任何因素致失去学籍者，视同自动离团。

第十一条（总团长及副总团长）

本团中央设总团部，其组织另定之。置总团长一人，对内综理团务，对外代表本团。

总团长由全体团员选举之，任期一年，不得连任，其选举办法另定之。

本团置副总团长一人，由总团长提请执委会通过后，由本党主席聘任之，其资格及任期与总团长同。

总团长因故无法领导本团时，应由副总团长代理之。

第十二条（指导委员会）

总团部设指导委员会，成员由总团长遴聘关心青年事务、学养俱佳之社会人士若干人担任，其组织办法另定之。

指导委员会置召集人一人，由总团长提请本党主席聘任之。

第十三条（执行委员会）

总团部设执行委员会（简称执委会），置委员十一人，其产生办法另定之。

执行委员会采合议制，由总团长召集之。

第十四条（分团）

本团以学校为单位设分团，其组织办法另定之。

第十五条（经费）

本团之经费来源：

（一）、团费。

（二）、中央党部补助。

（三）、募款。

（四）、委办活动收益。

（五）、基金及其孳息。

（六）、其他收入。

团员缴纳团费办法，由执行委员会另定之。

第十六条（经费之监督）

本团经费之收支，应依相关法令办理，并受本党中央委员会之监督。

第十七条（修正）

本章程之修正，应由总团长召集本团执行委员会，经全体委员二分之一以上出席，出席委员三分之二以上同意后为之，并报请中央常务委员会核备。

第十八条（施行）

本章程报请中央常务委员会核定后施行之。