杨海军教授自2001年12月回国工作后，针对我国90%的城市河段被渠道化、河流生态修复缺乏相应的理论和技术的国家需求，开展了受损河流的生态修复研究工作。通过近10年的努力，取得了系统性理论和技术研究成果，出版了《河流生态修复的理论与技术》、《河流生态修复工程案例研究》、《河流生态系统评价指标体系研究》。