1954年，原江西省农林厅水利局勘测设计处土工试验室成立。

1958年，设立江西省水利电力厅水利技术实验所。

1963年，改为“江西省水利电力科学研究所”。

1975年，提出狮子山共和国哥马水电站土坝工程试验分析报告；同年，创建江西省水利科学研究院堤坝白蚁防治中心。

1980年，经江西省政府办公厅批覆，改名为“江西省水利科学研究所”。

1994年10月，组织成立江西省水利水电基础工程有限公司。

1998年，获“全国科技界抗洪抢险先进集体”荣誉称号。

2002年8月，组织成立江西省洪图水利水电设计有限公司。

2004年9月7日，经江西省机构编制办公室批准更为江西省水利科学研究院。

2008年，经国家人力资源和社会保障部批准设立“博士后科研工作站”。

2010年，江西省科技厅批覆组建“江西省水工安全工程技术研究中心”。

2013年，江西省科技厅批覆组建“江西省鄱阳湖水资源与环境重点实验室”；同年博士后科研与实验楼开工建设。

据2018年7月研究院官网显示，研究院拥有职工240人，其中专业技术人员214人。硕士及以上学历144人，其中博士研究生27人、硕士研究生 117人；教授级高级工程师13人，高级工程师49人，工程师46人；享受国务院特殊津贴2人、水利部5151人才工程部级人选1人、省百千万人才工程人选6人。

享受国务院特殊津贴：许新发、李荣昉

省百千万人才工程人选：雷声、许新发等

据2018年7月研究院官网显示，研究院拥有7个科研团队，7个科研平台，设有院士工作站。

水利部研究中心：水利部鄱阳湖水资源水生态环境研究中心

省级重点实验室：江西省鄱阳湖水资源与环境重点实验室

省级工程技术中心：江西省水工安全工程技术研究中心

省级研究基地：鄱阳湖模型试验研究基地

省级科技创新团队：水资源综合调控与管理、农村水利、水工程安全与防灾减灾、水工模型试验研究、水生态环境保护与综合治理、水利信息化和水利发展战略研究

院研究所：信息与自动化研究所、生态研究所、水工程安全与灾害防治研究所、农村水利研究所、水资源水环境研究所、建筑与岩土研究所、河流湖泊研究所

截至2014年10月，研究所建设有前处理室、水环境实验室和水生态实验室，总面积为388平方米，具有监测水体、植被和底泥的理化性质，生物培养和监测的能力，建材与岩土研究所工作面积1350平方米，恆温室间30立方米，检测设备达215台套。

据2018年7月研究院官网显示，单位先后荣获全国抗洪先进单位、全国水利文明单位、全国水利系统和谐企事业单位、全国水利系统模範职工之家、全国水利管理先进单位、全国青年文明号、江西省文明单位、江西省五一劳动奖状、江西省青年文明号等一批荣誉称号。

截至2014年10月，江西省水利科学研究院先后与武汉大学、河海大学、南昌大学、南昌工程学院、长江科学院、南京水科院等高等院校和科研院所开展合作与交流；院士工作站与王浩、王超院士签署合作协定。

据2018年7月研究院官网显示，研究院立项科研项目320余项（其中中国国家自然科学基金项目13项），获得国家级、省部级等各级各类科技成果近140项，发表科技论文650篇（其中SCI、EI近50篇），获国家专利13项，出版专着13部，主（参）编国家、行业和地方标準5部。

《江西水利科技》是江西省水利厅主管，江西省水利科学研究院、江西省水利厅科技情报站、江西省水利学会主办的技术类期刊。主要刊登有关水利水电方面的科研成果和技术经验总结，及水利水电勘测、规划、设计、施工、监理、管理、水文、水保、防洪抢险、除险加固、小水电、水利经济计算、环境水利、乡镇供水、农田水利等多方面内容，同时还介绍中国国内外有关水利水电方面的先进技术。

2008年，经国家人力资源和社会保障部批准设立江西省水利科学研究院博士后科研工作站，已与中国科学院、中国水利水电科学研究院、清华大学、浙江大学、南昌大学、江西财经大学等院校的博士后流动站签订了联合招收培养博士后的工作协定并招收博士后18人。

据2018年7月研究院官网显示，研究院具用大坝安全鉴定、病险水库除险加固蓄水安全鉴定、水闸安全鉴定、岩土工程检测、混凝土工程检测、量测工程检测、金属结构检测、机械电气类检测、水资源论证、水文水资源调查与评价10项甲级资质；水土保持监测、水利工程设计河道整治专项、工程谘询3项乙级资质；地质灾害治理工程设计、水利工程设计综合2项丙级资质，水利工程施工2级总承包，在大型水利工程的整体物理模型试验研究、工程质量检测、安全监测系统的设计与实施、大中型水库（水闸）安全鉴定、水资源综合调控与管理、水生态环境保护与综合治理、农村水利和水利信息与自动化等方面为行业、社会提供技术服务。

院徽中心是由水字开头字母S抽象、艺术化形成的图案，图案外围为中英文对照的研究院名。

献身、负责、求实

团结、求实、开拓、创新