本丛书系我国古代最大的一部丛书。经十年纂修始成。共收图书三千五百零三种，分经、史、子、集四部，故名“四库”。

载录中医着名医籍九十七部，大多为医经典籍及历代名医名家代表之作，分为内经、难经类，伤寒、金匮类，针灸类，医方类，本草类，医案类，医学通论、医学全书类，其他着名医籍。

现存清文津阁抄本、清文溯阁抄本、清文渊阁抄本、清文澜阁抄本，以及1986年中医古籍出版社影印本等。