穗莞深城际轨道将直达广州市区，新建的石牌站和奥体中心站两个市内站点具体规划亮相。广深线Ⅲ、Ⅳ线（普速列车线路）广州东至新塘段改造工程石牌站、奥体中心站规划修改方案,获广州市城市规划委员会全票审议通过。石牌站将在广园快速路南侧选址，有规委会专家认为这将加剧广园路交通拥堵，建议西移，但广州市市长陈建华表示铁路线路动不了，只能在现有位置上规划研究交通方案。

为进一步最佳化广州铁路枢纽布局，中国铁路总公司、广东省人民政府于2014年同意实施广深线Ⅲ、Ⅳ线广州东至新塘段改造工程（以下简称改造工程），这一工程将使穗莞深城际轨道连通至广州东站，直达广州市区。此次提交市规委会进行规划方案调整的石牌站、奥体中心站，是改造工程新建站点中的两个。

石牌站、奥体中心站地块位于天河区广园快速路南侧，石牌站用地面积6898平方米，地块南面紧邻广深铁路和既有铁路站房，北部为中森食博会，地块周边较为空旷。拟建的石牌站站房为线侧平式站房，站房东、西面设定站前广场，站前广场附近规划布置公交停车场及小汽车停车场。站台通过6米宽的地道与站房联繫，旅客进出站採用“下进下出”的客流模式,站台设有雨棚。

此次工程对周边路段（广园快速路、华南快速路、科韵路、中山大道、黄村大道）及周边交叉口（广园立交、广园快速路汇景路立交、科韵路立交、黄村立交、奥体路-奥体南路交叉口）的影响在可接受範围之内。方案也规划了新建风雨连廊、行人天桥、地下通道、行人过街横道等设施，满足行人交通需求。

在道路交通方面，石牌站在广园快速路南北两侧规划地面10米辅道，设定东向西地面掉头车道，对机动车停车场出入口前后均进行拓宽，减少对辅道直行车辆的影响；奥体中心站规划配建机动车停车场右进右出交通组织。缓冲车道长70米，能够保障驶入车辆进入停车场，驶出车辆汇入广园快速路的需要，减小进出车辆对广园快速路和停靠公车的干扰。

改建工程已通过国土部门的建设用地预审，并先后取得广州市水务局、市环保局、市发改委、市文广新局的批覆。改建工程为广东省重点项目，原国家铁道部和广东省政府曾批覆石牌站、奥体中心站的建设计画于2015年3月开工，2017年3月竣工。由于现行控规的用地布局不能满足站点的建设要求，急需对控规进行调整。