1986年，《套用数学与计算数学学报》创刊。

2011年8月15日，《套用数学与计算数学学报》第二届编委会在上海大学召开。

据中国知网收录信息显示，2012年该刊由半年刊变更为季刊。

2013年11月22日，《套用数学与计算数学学报》2013年编委会在上海大学期刊社召开。

2014年11月，该刊成为原中国国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

2018年7月11日，该刊英文版网站正式上线。

《套用数学与计算数学学报》主要刊登有关套用数学与计算数学学术论文，及其在自然科学、工程技术、经济和社会等各领域的套用研究成果。

《套用数学与计算数学学报》主要设有自然科学、工程技术、经济、社会等栏目。

据2018年10月《套用数学与计算数学学报》官网显示，《套用数学与计算数学学报》编委会共有名誉编委4人，编委23人。

2014年4月24日下午，《套用数学与计算数学学报》编辑部在上海大学期刊社社长秦钠研究员的带领下，与上海大学数学系骨干教师开展座谈活动。

2014年10月16日，《套用数学与计算数学学报》编辑部成员赴同济大学数学系调研，并就“数学专业学术期刊的办刊模式与创新”议题进行座谈。

2016年1月14日下午，《套用数学与计算数学学报》发展座谈会在期刊社221会议室召开，编辑部主任潘春枝向与会人员汇报了学报的发展概况、学术指标等，并就如何提高学报的办刊质量与影响力展开了讨论。

2017年12月22日，《套用数学与计算数学学报》创刊30周年座谈会在上海大学期刊社多功能会议室召开，会议简单回顾了学报30年的发展历程，根据编辑部汇报的学报近年来的发展情况，与会编委就学报目前存在的困难和如何提高学报的影响力进行了讨论。

据2018年10月19日中国知网显示，《套用数学与计算数学学报》出版文献共1108篇。

据2018年10月19日万方数据知识服务平台显示，《套用数学与计算数学学报》载文量为758。

2012年9月，复旦大学程晋教授、陈文斌教授、陆帅副教授组织中国国内部分中青年学者为《套用数学与计算数学学报》数学物理反问题的专辑撰写了稿件，并成功出版了这本“反问题专辑”。该期专辑由8篇文章组成，按照内容，可以分成两类：（1）研究一些重要的实际问题中提出的数学物理反问题，经过一定分析，提出可行的计算方法，做出了一些可信的数值模拟. 论文包括：刘明辉、马富明的《雷达波形设计的一个数值方法》；毛衡、王薇、韩波的《基于贝叶斯-稀疏正则化的地震波形反演》；李功胜、贾现正、张大利的《对流弥散方程的时间依赖係数反演及其套用》；徐定华、葛宝林、陈瑞林的《基于服装舒适性的纺织材料设计反问题》；牛俊、方涵先的《电离层层析成像及数值模拟》。（2）针对一些反问题的不适定性，提出和分析了一些新的正则化方法.论文包括：刘佳的《一维热传导方程移动边界识别的计算方法》；钱志的《热方程侧边值问题的正则化方法及频域中的修改“核”思想》；石万霞、熊向团的《多层介质中逆热传导问题的傅立叶正则化方法》。

据2018年10月19日中国知网显示，《套用数学与计算数学学报》总被下载84872次、总被引3280次；（2018版）複合影响因子为0.196、（2018版）综合影响因子为0.159。

据2018年10月19日万方数据知识服务平台显示，《套用数学与计算数学学报》被引量为1875、下载量为10864、影响因子为0.165。

据2018年10月《套用数学与计算数学学报》官网显示，《套用数学与计算数学学报》被美国《数学评论》（MR）、德国《数学文摘》（ZM）、中国期刊网全文收录、中国学术期刊（光碟版）全文收录、中国学术期刊综合评价资料库来源期刊、中国数学文摘资料库、万方数据—数位化期刊群资料库、中国核心期刊（遴选）资料库、中文科技期刊资料库（维普资讯）、中国学术期刊网路出版总库、中国期刊全文资料库收录。

反映套用数学与计算数学领域中的最新研究成果，刊登有关套用数学与计算数学学术论文，及其在自然科学、工程技术、经济和社会等各领域的套用研究成果。