庙岛海峡最宽约最9.9公里，窄约7.6公里，宽约3.3公里，面积约25平方千米。位于南长山岛和山东半岛之间。其中最短的距离是蓬莱县的蓬莱角与南长山岛的南部的江字头。

庙岛海峡是渤海海峡的一部分。虽然很浅，但对渤海很重要。因为渤海只有渤海海峡这一个通道连线黄海，所以水的循环都进出渤海海峡。而渤海海峡被庙岛群岛分成了许多小水道。进入渤海的洋流被这些小岛分成了许两大部分，一个支流通过老铁山水道进入渤海，另一个则通过庙岛海峡，所以海峡的水流速度较快，水中的营养物质也较多。从渤海各港口出发到渤海外的四条大航线中，就有一条经过庙岛海峡，其余的经过老铁山水道。

庙岛海峡北岸有大港口长岛，南面则有蓬莱市，海峡两岸并没有养殖区，所以水质较乾净，营养物质，浮游生物等也很多。此外中国的海峡很少，不足十条，而庙岛海峡就是其中之一。其余几条为里长山海峡、外长山海峡、渤海海峡、台湾海峡、琼州海峡、海坛海峡、巴士海峡（中菲各占一半。）