热那亚是着名航海家哥伦布的故乡。1893年6月，英国人将足球带到了义大利。几个年轻的英国人求见领事派顿先生，要求成立一个体育俱乐部。“我们是英女王陛下的臣民，因为工作原因住在热那亚，我们觉得有必要在这里引入一些运动项目，最重要的是足球。”足球就这样在义大利诞生了，最早是G.D法库斯创办的热那亚板球和竞技俱乐部。1886年起，该俱乐部改名为热那亚板球和足球俱乐部。

1898年，热那亚夺取了义大利第一届联邦锦标赛，并在前七届联赛中六获冠军，其中在1898-1900年以及1902年-1904年两度获得三连冠。1929-30赛季，首届意甲联赛揭幕，热那亚以2分之差排在国际米兰之后，屈居亚军，这也是该队最后的辉煌时刻。

在60年代以后热那亚的成绩就一直在意甲的中下游徘徊，94-95赛季降入意乙之后在意乙打了11个赛季之后，终于再次升入甲级。

在2004/05赛季意乙联赛最后一轮比赛中，老牌强队热那亚队3-2击败威尼斯队，最终以意乙冠军的身份在10年后重返意甲。不过义大利足协经过调查后发现，那场比赛双方有作假行为，为了稳赢比赛，热那亚付给了威尼斯25万欧元。意足协风纪股长会经过研究，决定对这桩“假球案”予以重罚；不仅剥夺了热那亚队晋级意甲的资格，还将其降入丙级，并将在参加丙级联赛时被扣除3分。此外，热那亚俱乐部主席普雷齐奥西和威尼斯俱乐部主席奇恩被分别禁止5年内不得参与任何体育经营活动。随后，热那亚俱乐部提出抗诉，但义大利足协在2005年8月8日驳回了热那亚俱乐部的申诉请求，维持此前对热那亚队涉嫌打假球的处罚结果。即热那亚队不但无法晋级义大利足球甲级联赛，还将被降级到丙级。

热那亚是义大利历史最悠久的足球俱乐部。他们在历史上战绩辉煌，从1898年到1924年总计获得过9次意甲冠军，在七年的时间内两次达成三连冠，意甲夺冠总次数在全国排名第四，仅次于尤文图斯，AC米兰和国际米兰，然而1924年后，他们一次也未能夺冠。近年来，他们一直在甲级和乙级之间沉浮。2004-05赛季曾夺得意乙冠军，但可惜在最后一场以2比3败予摩德纳被判打假球罪名成立。不能升班外亦降至丙组。但在2006-07赛季他们取得了乙级联赛第三名的成绩，得以回到意甲联赛。热那亚在其返回意甲联赛的首个赛季获得排名联赛第10位的成绩。而在2008-09赛季意甲联赛中，热那亚在积分相同的情况下因相互胜负劣势排名联赛第五位，因而得以获得参加下赛季欧洲联赛的资格。